В прошлом Ыгдырский университет продолжал свою образовательную деятельность под названием Игдырское профессиональное училище . Профессиональное училище Ыгдыр, основанное в 1995 году как подчиненное Университету Кафкаса , обслуживало только 20 студентов факультета делового администрирования, 16 инструкторов, 1 служащего и 1 государственного служащего.Попытки создать факультет, начатые в 2001 году, дали результаты в 2006 году, и Ыгдырский сельскохозяйственный факультет был основан в Ыгдыре как филиал Университета Кафкаса . Факультет, занявший свое место в справочнике ÖSS 2008 года и начавший обучение с 30 студентами, был создан под названием «Университет Ыгдыр» в 2008-2009 учебном году, а его первым ректором был проф. Др. Ибрагим Х. Йылмаз стал. В марте 2017 года Мехмет Хакки Алма был назначен новым ректором Университета Ыгдыр. На выборах в ректорат 2021 г. проф. Др. Мехмет Хакки АЛМА был переизбран ректором Университета Ыгдыр.